获奖年度	获奖名称	主要完成人	获奖类别	获奖等级	完成单位
1997年	多巴丝肼胶囊		第四届上海科学技术博览会奖	优秀奖	中国科学院上海药物研究所
1997年	阿法骨化醇		第四届上海科学技术博览会奖	金奖	中国科学院上海药物研究所
1997/12/19		中国科学院上海药物研究所	1996年国际科技论文被引证数全国研究机构第十八名		中国科学院上海药物研究所
1997/12/19		中国科学院上海药物研究所	1996年SCI系统科技论文数全国研究机构第十四名		中国科学院上海药物研究所
1997/12/16	免疫调节剂——牛膝多糖	李晓玉（第2完成者）、屠曾宏（第6完成者）	中国科学院技术发明奖	二等奖	中国科学院上海药物研究所
1997/12/05	抗肿瘤药物筛选模型的研究		中国科学院自然科学奖	三等奖	中国科学院上海药物研究所
1997/12/05	基于蛋白质和核酸三维结构知识的药物设计		中国科学院自然科学奖	二等奖	中国科学院上海药物研究所
1997/11/26	阿尼西坦-脑功能改善新药	刘明章（第4完成者）	上海市科学技术进步奖	二等奖	中国科学院上海药物研究所
1996年6月	治疗记忆障碍新药石杉碱甲片	钱伯初、唐希灿、周芝芳、刘加生、沈秀文、黄梅芬、周蓉蓉、朱大元、韩燕艺、汪明、林志红、陈凯、张锐武	浙江省医学科技进步奖	一等奖	浙江医学科学院、中国科学院上海药物研究所、上海医科大学红旗制药厂
1996年5月	槐耳冲剂治疗肝癌	庄毅、徐荷芬、周树云、阎玉森、陈慎宝	国家中医药管理局中医药科学技术进步奖	二等奖	南京中医药大学、江苏省中医药研究所、中国人民解放军第八一医院、中国科学院上海药物研究所、南京医科大学